Το Πάνορμο έχει τακτική συγκοινωνία από/προς Ρέθυμνο με αστικό και υπεραστικό λεωφορείο και από/προς Ηράκλειο και Χανιά με υπεραστικό λεωφορείο.

Εξυπηρετείται επίσης από δύο διεθνή αεροδρόμια, του Ηρακλείου (61 χλμ) και των Χανίων (95 χλμ), στα οποία προσγειώνεται καθημερινά σημαντικός αριθμός πτήσεων κανονικών και charter.

Στις ίδιες πόλεις, υπάρχουν επίσης 2 μεγάλα λιμάνια, που συνδέουν την Κρήτη με την Αθήνα (λιμάνι Πειραιά) αλλά και με άλλα νησιά του Αιγαίου πελάγους. Από το λιμάνι του Ηρακλείου υπάρχει καθημερινή σύνδεση με Σαντορίνη.